San Cristóbal es la isla habitada más oriental y la capital de la provincia, pero se siente más pequeña y más lenta que Santa Cruz. Puerto Baquerizo Moreno se curva en torno a una bahía donde los lobos marinos se han apoderado de las playas, los bancos y a veces los barcos; el largo malecón lleva al Centro de Interpretación y sube a Cerro Tijeretas, donde Darwin pisó tierra por primera vez en 1835. La estrella de la isla es León Dormido, un cono de toba partido a una hora de la costa donde snorkelers y buzos se encuentran con martillos, tortugas y rayas en el canal. Más lejos están Punta Pitt, el único sitio donde anidan juntas las tres especies de piqueros, y Española, la isla más antigua, con sus albatros. La parte alta guarda una laguna de agua dulce y una reserva de tortugas a la que se llega en taxi.
